Fiji：バイオテクノロジーおよび毒性学における画像処理のトレーニングコース

FijiおよびImageJの概要

• 『Fiji』が科学研究においてどのような用途があるかの概観を紹介する。
• ImageJの構造およびプラグインについて理解する。
• 最適なパフォーマンスが得られるようFijiをインストール・設定する方法を学ぶ。

基本的な画像処理手法

• 画像の取得および読み込み可能なファイル形式について理解する。
• コントラストや明るさの調整、各種フィルタ適用方法を習得する。
• 画像スタッキングおよび投影処理手法について学ぶ。

高度な画像解析

• 閾値設定やエッジ検出などのセグメンテーション技法を習得する。
• 組織標本における物体の数え方および粒子解析法について学ぶ。
• 面積や周囲長など、形態学的な特徴を測定する方法を習得する。

生物サンプル処理の実践

• 組織標本、血球および藻類の画像処理法について学ぶ。
• 染色された組織の色分解および解析手順を習得する。
• タイムラプス分析や細胞運動の追跡方法について学ぶ。

自動化とカスタマイズ技術

• 反復的作業を処理するためのマクロ作成および実行法を習得する。
• 特殊な解析ニーズに対応したFijiプラグインの利用方法を学ぶ。
• ImageJマクロ言語（IJM）による基本的なスクリプト作成法について学ぶ。

データ管理およびレポート作成

• 解析結果のエクスポートやレポート作成方法を習得する。
• 画像への注釈付けや学術論文向けデータ準備法について学ぶ。
• 再現性の高い画像解析を実現するためのベストプラクティスを習得する。

総括および今後の学びへのステップ