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コース概要
FijiとImageJの紹介
- Fijiとその科学的研究への適用について
- ImageJのアーキテクチャとプラグインの理解
- 最適なパフォーマンスのためにFijiをインストールおよび設定する方法
基本的な画像処理技術
- 画像の取得とインポート形式
- コントラスト、明るさの調整とフィルターの適用
- 画像スタックと投影方法
高度な画像解析
- セグメンテーション技術：閾値処理とエッジ検出
- 組織学的サンプルのオブジェクト計数と粒子解析
- 面積、周長、その他の形態学的特徴の測定
生物試料の処理
- 組織学的な組織、血液細胞、藻類の画像処理
- 色分解と染色組織の解析
- 時間経過解析と細胞移動の追跡
自動化とカスタマイズ
- 反復的なタスク用にマクロを作成および実行する方法
- 専門的な解析用のFijiプラグインの使用
- ImageJマクロ言語（IJM）を使用した基本的なスクリプト作成
データ管理とレポート作成
- 結果のエクスポートとレポートの生成
- 画像への注釈付けと出版用データの準備
- 再現可能な画像解析のためのベストプラクティス
要約と次のステップ
要求
- 生物画像に関する基本的な理解
- 倍率顕微鏡や組織学的手法の知識
- パソコンの基本的な操作能力
対象者
- バイオテクノロジーと環境毒性学の研究者
- 組織学的および細胞画像を扱う実験室技術者
- 定量的な画像解析に興味のある科学者
14 時間
