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コース概要
Pythonプログラミング言語の概要
- なぜPythonなのか?
- 生物データを扱うためのPythonの利用
- iPythonシェルでの作業
- 最初のプログラム
- Pythonスクリプトの書き方
- モジュールのインポート
タンパク質とRNA/DNA配列の取り扱い
- モチーフの探索
- in silicoでの転写と翻訳
- 配列アライメントの処理
異なる生物学形式のデータ解析
- FASTAの解析
- データフォーマットの変換
生物分析の実行
- BLAST
- 生物学ウェブサービスへのアクセス
Pythonを使用した3D構造の取り扱い
統計解析を容易にするPython
データの可視化
- 棒グラフと散布図の作成
- 面積曲線 (AUC) の計算
.xls および .csv ファイルの取り扱い
- MS Excel / OpenOffice Calcからデータをインポートし、エクスポートする方法
- .xls および .csv ファイルの書き方
Pythonを使用した自動化されたデータ処理パイプラインの作成
要求
タンパク質、RNA、DNA配列に関する基本的な生物学的知識
28 時間
お客様の声 (1)
トレーナーのアクセシビリティと、非常に効果的にコミュニケーションを取る能力,
Ciprian Ilie - Institutul National de Sanatate Publica
コース - Programming for Biologists
機械翻訳