コース概要

Python プログラミング言語の紹介

  • なぜPythonなのでしょうか?
  • Python を使用して生物学的データを処理する
  • iPython シェルの操作
  • 初めてのプログラム
  • Python スクリプトの作成
  • モジュールのインポート

タンパク質および RNA/DNA 配列の操作

  • 動機を見つける
  • コンピュータでの転写と翻訳
  • 配列アライメントの処理

さまざまな生物学的フォーマットでのデータの解析

  • FASTA の解析
  • データ形式の変換

生物学的分析の実行

  • ブラスト
  • Access生物学的 Web サービス

Python を使用した生物学的な 3D 構造の処理

Python 統計分析を容易にする

データの視覚化

  • 棒グラフと散布図の作成
  • 曲線下面積 (AUC) の計算

.xls および .csv ファイルの操作

  • MS Excel / OpenOffice Calc とのデータのインポートおよびエクスポート
  • .xls および .csv ファイルの書き込み

Python を使用して自動データ処理パイプラインを作成する

要求

タンパク質、RNA、DNA配列に関する生物学的基礎知識。

 28 時間

参加者の人数



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