コース概要

Pythonプログラミング言語の概要

  • なぜPythonなのか?
  • 生物データを扱うためのPythonの利用
  • iPythonシェルでの作業
  • 最初のプログラム
  • Pythonスクリプトの書き方
  • モジュールのインポート

タンパク質とRNA/DNA配列の取り扱い

  • モチーフの探索
  • in silicoでの転写と翻訳
  • 配列アライメントの処理

異なる生物学形式のデータ解析

  • FASTAの解析
  • データフォーマットの変換

生物分析の実行

  • BLAST
  • 生物学ウェブサービスへのアクセス

Pythonを使用した3D構造の取り扱い

統計解析を容易にするPython

データの可視化

  • 棒グラフと散布図の作成
  • 面積曲線 (AUC) の計算

.xls および .csv ファイルの取り扱い

  • MS Excel / OpenOffice Calcからデータをインポートし、エクスポートする方法
  • .xls および .csv ファイルの書き方

Pythonを使用した自動化されたデータ処理パイプラインの作成

要求

タンパク質、RNA、DNA配列に関する基本的な生物学的知識

 28 時間

参加者の人数


参加者1人当たりの料金

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